MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori 26695 chromosome

Total Repeats: 34855

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000915	CAT	2	6	185	190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_000915	T	6	6	190	195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000915	TGAG	2	8	233	240	25 %	25 %	50 %	0 %	15644635
4	NC_000915	CATT	2	8	320	327	25 %	50 %	0 %	25 %	15644635
5	NC_000915	GAT	3	9	328	336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644635
6	NC_000915	T	6	6	465	470	0 %	100 %	0 %	0 %	15644635
7	NC_000915	AAAGCG	2	12	494	505	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15644635
8	NC_000915	GTTG	2	8	507	514	0 %	50 %	50 %	0 %	15644635
9	NC_000915	T	7	7	524	530	0 %	100 %	0 %	0 %	15644635
10	NC_000915	T	7	7	552	558	0 %	100 %	0 %	0 %	15644635
11	NC_000915	TTC	2	6	562	567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644635
12	NC_000915	ACA	2	6	588	593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644635
13	NC_000915	C	6	6	606	611	0 %	0 %	0 %	100 %	15644635
14	NC_000915	CAA	2	6	662	667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644636
15	NC_000915	C	6	6	848	853	0 %	0 %	0 %	100 %	15644636
16	NC_000915	CT	3	6	897	902	0 %	50 %	0 %	50 %	15644636
17	NC_000915	AAT	2	6	903	908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15644636
18	NC_000915	TAAAA	2	10	914	923	80 %	20 %	0 %	0 %	15644636
19	NC_000915	CTT	2	6	1006	1011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644636
20	NC_000915	TCTG	2	8	1016	1023	0 %	50 %	25 %	25 %	15644636
21	NC_000915	TGA	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644636
22	NC_000915	AAAT	2	8	1118	1125	75 %	25 %	0 %	0 %	15644637
23	NC_000915	AAC	2	6	1230	1235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644637
24	NC_000915	CCG	3	9	1249	1257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15644637
25	NC_000915	CCA	2	6	1393	1398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15644637
26	NC_000915	GCT	2	6	1418	1423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15644637
27	NC_000915	CA	3	6	1432	1437	50 %	0 %	0 %	50 %	15644637
28	NC_000915	T	6	6	1449	1454	0 %	100 %	0 %	0 %	15644637
29	NC_000915	TC	3	6	1491	1496	0 %	50 %	0 %	50 %	15644637
30	NC_000915	T	6	6	1553	1558	0 %	100 %	0 %	0 %	15644637
31	NC_000915	GGC	2	6	1609	1614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15644637
32	NC_000915	GCTT	2	8	1661	1668	0 %	50 %	25 %	25 %	15644637
33	NC_000915	CT	3	6	1767	1772	0 %	50 %	0 %	50 %	15644637
34	NC_000915	TAAAA	2	10	1807	1816	80 %	20 %	0 %	0 %	15644637
35	NC_000915	GTT	2	6	1829	1834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644637
36	NC_000915	CTT	2	6	1863	1868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644637
37	NC_000915	A	7	7	1983	1989	100 %	0 %	0 %	0 %	15644638
38	NC_000915	ATTATA	2	12	2001	2012	50 %	50 %	0 %	0 %	15644638
39	NC_000915	CCTG	2	8	2016	2023	0 %	25 %	25 %	50 %	15644638
40	NC_000915	ATG	2	6	2029	2034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644638
41	NC_000915	CCAA	2	8	2040	2047	50 %	0 %	0 %	50 %	15644638
42	NC_000915	ATTC	2	8	2057	2064	25 %	50 %	0 %	25 %	15644638
43	NC_000915	TGAA	2	8	2080	2087	50 %	25 %	25 %	0 %	15644638
44	NC_000915	GTT	2	6	2103	2108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644638
45	NC_000915	GC	3	6	2118	2123	0 %	0 %	50 %	50 %	15644638
46	NC_000915	T	6	6	2182	2187	0 %	100 %	0 %	0 %	15644638
47	NC_000915	CTT	2	6	2192	2197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644638
48	NC_000915	TGG	2	6	2249	2254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644638
49	NC_000915	TCA	2	6	2257	2262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644638
50	NC_000915	G	6	6	2395	2400	0 %	0 %	100 %	0 %	15644638
51	NC_000915	CA	3	6	2481	2486	50 %	0 %	0 %	50 %	15644638
52	NC_000915	ATTC	2	8	2555	2562	25 %	50 %	0 %	25 %	15644638
53	NC_000915	GTTT	2	8	2633	2640	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000915	A	8	8	2747	2754	100 %	0 %	0 %	0 %	15644639
55	NC_000915	TCTT	2	8	2763	2770	0 %	75 %	0 %	25 %	15644639
56	NC_000915	T	7	7	2843	2849	0 %	100 %	0 %	0 %	15644639
57	NC_000915	TGA	2	6	2868	2873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644639
58	NC_000915	T	7	7	2885	2891	0 %	100 %	0 %	0 %	15644639
59	NC_000915	AGC	2	6	2983	2988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644639
60	NC_000915	GC	3	6	2996	3001	0 %	0 %	50 %	50 %	15644639
61	NC_000915	A	6	6	3034	3039	100 %	0 %	0 %	0 %	15644639
62	NC_000915	AG	3	6	3153	3158	50 %	0 %	50 %	0 %	15644639
63	NC_000915	GTG	2	6	3172	3177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644639
64	NC_000915	CAAA	2	8	3306	3313	75 %	0 %	0 %	25 %	15644639
65	NC_000915	GTG	2	6	3331	3336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644639
66	NC_000915	GCC	2	6	3338	3343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15644639
67	NC_000915	TTG	2	6	3422	3427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644640
68	NC_000915	AG	3	6	3433	3438	50 %	0 %	50 %	0 %	15644640
69	NC_000915	GAA	2	6	3454	3459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644640
70	NC_000915	GAAA	2	8	3528	3535	75 %	0 %	25 %	0 %	15644640
71	NC_000915	GTT	2	6	3784	3789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644640
72	NC_000915	CA	3	6	3981	3986	50 %	0 %	0 %	50 %	15644640
73	NC_000915	A	6	6	4022	4027	100 %	0 %	0 %	0 %	15644640
74	NC_000915	CAG	2	6	4030	4035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644640
75	NC_000915	A	6	6	4072	4077	100 %	0 %	0 %	0 %	15644640
76	NC_000915	ATT	2	6	4112	4117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15644640
77	NC_000915	TGT	2	6	4123	4128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644640
78	NC_000915	TGG	2	6	4181	4186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644640
79	NC_000915	GGT	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000915	TAT	2	6	4339	4344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000915	TGG	2	6	4382	4387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_000915	ATGC	2	8	4486	4493	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_000915	TGG	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_000915	GTG	2	6	4618	4623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000915	ACC	2	6	4650	4655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_000915	GGT	2	6	4663	4668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000915	T	8	8	4802	4809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000915	AAT	2	6	4823	4828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000915	TAAA	2	8	4891	4898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000915	A	6	6	4896	4901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000915	TAT	2	6	4959	4964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_000915	T	7	7	4964	4970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000915	A	6	6	4979	4984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000915	TTA	2	6	5014	5019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000915	T	7	7	5031	5037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_000915	A	6	6	5042	5047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000915	A	6	6	5058	5063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000915	TTTTA	2	10	5116	5125	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_000915	A	6	6	5167	5172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000915	A	7	7	5181	5187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_000915	A	8	8	5198	5205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_000915	TCGC	2	8	5377	5384	0 %	25 %	25 %	50 %	15646197
103	NC_000915	ATTC	2	8	5406	5413	25 %	50 %	0 %	25 %	15646197
104	NC_000915	CATT	2	8	5450	5457	25 %	50 %	0 %	25 %	15646197
105	NC_000915	ATT	2	6	5472	5477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15646197
106	NC_000915	C	6	6	5535	5540	0 %	0 %	0 %	100 %	15646197
107	NC_000915	TGG	2	6	5570	5575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15646197
108	NC_000915	A	7	7	5682	5688	100 %	0 %	0 %	0 %	15646197
109	NC_000915	ATA	2	6	5691	5696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15646197
110	NC_000915	TCT	2	6	5709	5714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15646197
111	NC_000915	T	6	6	5714	5719	0 %	100 %	0 %	0 %	15646197
112	NC_000915	A	6	6	5724	5729	100 %	0 %	0 %	0 %	15646197
113	NC_000915	GTT	2	6	5772	5777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15646197
114	NC_000915	TAA	2	6	5841	5846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15646197
115	NC_000915	TTA	2	6	5899	5904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15646197
116	NC_000915	GTG	2	6	5968	5973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15646197
117	NC_000915	GTT	2	6	5988	5993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15646197
118	NC_000915	GC	3	6	6030	6035	0 %	0 %	50 %	50 %	15646197
119	NC_000915	CAA	2	6	6036	6041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15646197
120	NC_000915	TTGAT	2	10	6052	6061	20 %	60 %	20 %	0 %	15646197
121	NC_000915	C	6	6	6134	6139	0 %	0 %	0 %	100 %	15646197
122	NC_000915	AGT	2	6	6200	6205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15646197
123	NC_000915	T	6	6	6240	6245	0 %	100 %	0 %	0 %	15646197
124	NC_000915	GCTTGC	2	12	6274	6285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15646197
125	NC_000915	CAG	2	6	6320	6325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15646197
126	NC_000915	GTT	2	6	6372	6377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15646197
127	NC_000915	AC	3	6	6459	6464	50 %	0 %	0 %	50 %	15646197
128	NC_000915	CTT	2	6	6566	6571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15646197
129	NC_000915	TAG	8	24	6593	6616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15646197
130	NC_000915	TTA	2	6	6625	6630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15646197
131	NC_000915	TGT	2	6	6645	6650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15646197
132	NC_000915	TTG	2	6	6717	6722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15646197
133	NC_000915	GTT	2	6	6786	6791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15646197
134	NC_000915	CCG	2	6	6920	6925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15646197
135	NC_000915	T	6	6	6968	6973	0 %	100 %	0 %	0 %	15646197
136	NC_000915	ATCG	2	8	7008	7015	25 %	25 %	25 %	25 %	15646197
137	NC_000915	GCT	2	6	7035	7040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15646197
138	NC_000915	CGTT	2	8	7043	7050	0 %	50 %	25 %	25 %	15646197
139	NC_000915	TTGA	2	8	7056	7063	25 %	50 %	25 %	0 %	15646197
140	NC_000915	GTT	2	6	7065	7070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15646197
141	NC_000915	T	6	6	7116	7121	0 %	100 %	0 %	0 %	15646197
142	NC_000915	A	6	6	7182	7187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_000915	GA	11	22	7221	7242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_000915	T	7	7	7252	7258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_000915	AAATT	2	10	7274	7283	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_000915	TAAG	2	8	7306	7313	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_000915	T	14	14	7345	7358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_000915	T	6	6	7389	7394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_000915	GTTT	2	8	7399	7406	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_000915	GGT	2	6	7408	7413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_000915	G	6	6	7551	7556	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_000915	T	6	6	13408	13413	0 %	100 %	0 %	0 %	15644647
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292	NC_000915	T	7	7	13645	13651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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